НПК «Криптонит» входит в «ИКС Холдинг» — российскую многопрофильную ИТ-группу, основные задачи которой — инвестиции, управление и консолидация на рынке телком-медиа и технологий. На базе НПК действует уникальный научно-исследовательский центр (R&D), объединяющий несколько лабораторий. В числе приоритетных направлений — криптография и информационная безопасность, телекоммуникации, технологии и решения в области хранения, обработки и управления большими данными, машинное обучение и нейросети.