Повысить выживаемость рыбы в хозяйствах на 20–25%, сделать ее устойчивее к мутациям и даже сэкономить до 30% корма — все это позволяют синбиотические добавки для аквакультуры, разработанные учеными из Донского государственного технического университета при поддержке Российского научного фонда. Новые препараты также укрепляют иммунитет животных и помогают им быстрее расти. О секретах передовой разработки корреспонденту «Научной России» рассказывает руководитель масштабного проекта, декан факультета «Агропромышленный» ДГТУ, профессор РАН, доктор технических наук Дмитрий Владимирович Рудой.

Синбиотики — препараты, сочетающие в своем составе пробиотики и пребиотики. Другими словами, новые кормовые добавки одновременно содержат и полезные для рыб бактерии, и вещества, стимулирующие рост микроорганизмов. К настоящему времени исследователи представили линейку из 27 синбиотических препаратов.

Декан факультета «Агропромышленный» ДГТУ, профессор РАН, доктор технических наук Дмитрий Владимирович Рудой.Фото: Дарьяна Буряк / архив отдела медиасопровождения управления информационной политики ДГТУ

Декан факультета «Агропромышленный» ДГТУ, профессор РАН, доктор технических наук Дмитрий Владимирович Рудой.

Фото: Дарьяна Буряк / архив отдела медиасопровождения управления информационной политики ДГТУ

 

«Добавки создаются для широкого круга объектов аквакультуры. В ходе испытаний мы работали с разными видами: это и ценные осетровые (стерлядь, бестер), и популярные лососевые (форель, стальноголовый лосось), и карповые, а также новые для отечественной аквакультуры виды, такие как африканский клариевый сом и тилапия (Tilapia), — говорит Д.В. Рудой. — Основной и наиболее эффективный способ применения препаратов — смешивание их непосредственно с комбикормом. Это позволяет доставить пробиотические бактерии напрямую в кишечник, где они и должны работать.

В качестве пребиотиков мы используем как классические вещества природного происхождения, например инулин из корня цикория, так и более сложные компоненты, включая “зеленый” белок — концентрат растительного белка из подсолнечника, богатый хлорогеновой кислотой. Эти компоненты служат питательной средой для наших пробиотических бактерий».

Ученые реализуют проект с 2023 г. совместно с индустриальным партнером — рыбным хозяйством «Прибой» из Волгоградской области, активно инвестирующим в исследования. Компания выращивает осетровых, форель и карповых.

Изъятие рыб из бассейна для оценки рыбоводно-биологических параметров.Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

Изъятие рыб из бассейна для оценки рыбоводно-биологических параметров.

Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

 

Создавая инновационные добавки, ученые задействовали возможности передовых молекулярно-генетических методов. Проведя предварительное исследование, авторы проекта установили, что для обеспечения наилучшего эффекта пробиотик должен состоять не из одного штамма, а из целого консорциума микроорганизмов. Но как собрать «команду» из бактерий так, чтобы она оказывала на животных нужное действие? В этом исследователям помог генетический анализ отдельных штаммов микроорганизмов, позволивший отобрать для дальнейшей работы бактерии с полезными свойствами и комбинировать разные штаммы микроорганизмов таким образом, чтобы те органично дополняли друг друга.

В поисках подходящих бактерий авторы проекта обратились за помощью к природе. И она не подвела: в результате работы в полевых условиях ученым удалось собрать уникальный обширный банк штаммов.

«Поиск мы вели не в лабораторных коллекциях, а в естественной среде — в донных отложениях реки Дон. Бактерии из ила — естественные обитатели экосистемы, где присутствуют рыбы, — отмечает Д.В. Рудой. — На первом этапе мы выделили более 100 штаммов, а затем провели многоступенчатый скрининг. Сначала мы оценивали их ферментативную активность, безопасность, способность бороться с патогенами, антиоксидантные и ДНК-протекторные свойства. В результате были отобраны 13 самых перспективных штаммов. Их уникальность заключается в том, что, помимо высокой пробиотической активности, они автохтонны (то есть представляют собой естественных сожителей рыб в экосистеме. — Примеч. авт.), благодаря чему гораздо лучше приживаются в кишечнике рыб. Мы провели полногеномное секвенирование для этих штаммов, изучили все их генетические особенности и депонировали информацию в международные базы данных, такие как GenBank (NCBI), DDBJ, EMBL-EBI, INSDC».   

Внешний вид колоний пробиотических штаммов на плотной питательной среде.Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

Внешний вид колоний пробиотических штаммов на плотной питательной среде.

Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

 

Как и в любом комплексном исследовании, на пути к результату ученым пришлось разработать несколько необходимых сопутствующих технологий: в частности, продумать методики совместного выращивания разных бактериальных штаммов и последующей сушки добавок.

По своим функциям полученные препараты делятся на четыре типа.

«Разработанные добавки — линейка мультиштаммовых пробиотиков, отличающихся друг от друга прежде всего набором бактериальных штаммов и их функциональными свойствами: ферментативные (для улучшения переваривания комбикорма), антиоксидантные (для защиты от стресса), антимикробные (для профилактики инфекций) и антимутагенные (защита генетического материала от мутаций). Мы разработали методики, позволяющие сочетать штаммы, избегая антагонизма и подавления ими друг друга, — говорит Д.В. Рудой. — Конкретная добавка всегда подбирается индивидуально в зависимости от вида рыбы, ее возраста и текущих проблем хозяйства».

Сначала новые препараты тестировались в условиях, приближенных к реальному рыбному хозяйству, затем — на реальных предприятиях Волгоградской и Ростовской областей, а также Краснодарского края. Многократные эксперименты подтвердили, что добавки укрепляют здоровье рыб и повышают их выживаемость на 20–25%. Примечательно, что препараты в том числе положительно влияют на жизнестойкость молодых особей. Это открывает потенциальную возможность применения новых синбиотиков для восстановления популяций рыб в Азовском море. 

Целевые объекты разработки синбиотических кормовых добавок — представители семейства Осетровых (Acipenseridae).Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

Целевые объекты разработки синбиотических кормовых добавок — представители семейства Осетровых (Acipenseridae).

Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

 

Крепкий иммунитет животных — еще не все. С новыми добавками рыбы быстрее набирают массу, что также немаловажно для отрасли. По словам Д.В. Рудого, в опытных группах рыба в среднем росла быстрее на 10–15%.

Что касается экономии корма, то за нее отвечают уже упомянутые ферментативные пробиотики. Механизм прост: рыбы более полноценно усваивают питательные вещества и за счет этого обходятся меньшим количеством пищи.

«Экономия комбикорма достигается за счет значительной оптимизации его конверсии (прироста массы животного на единицу съеденного корма. — Примеч. авт.). Пробиотики, особенно ферментативного типа, продуцируют в кишечнике рыб ферменты, помогающие животным более полно расщеплять и усваивать из комбикорма питательные вещества, которые без них выходили бы непереваренными. Во всех наших экспериментах мы фиксировали снижение коэффициента конверсии корма на 15–20%, при использовании отдельных штаммов этот показатель доходил до 30%», — делится Д.В. Рудой.

Учет ферментативной активности пробиотических штаммов.Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

Учет ферментативной активности пробиотических штаммов.

Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

 

Чтобы пронаблюдать, как новые синбиотики влияют на организмы животных, ученые проводили глубокие исследования посредством разнообразных технологий. Так, с помощью молекулярно-генетических методов они отследили, как препараты меняют активность более 200 генов в клетках мозга, печени и жабр стерляди. Результаты подтвердили, что добавки укрепляют иммунитет животных и препятствуют развитию воспалений.

«Чтобы понять, как добавки влияют на организм рыбы на молекулярном уровне, мы используем транскриптомный и ПЦР-анализ. Мы выделяем из тканей рыбы (например, из кишечника, печени или мышц) генетический материал и после проведения анализов получаем полную картину того, какие гены работают в данный момент. Сравнивая транскриптомы рыб из контрольной и опытной групп, мы видим, как пробиотики влияют на экспрессию сотен генов, связанных с иммунитетом, ростом, стрессом и обменом веществ», — рассказывает Д.В. Рудой.

На этапе предварительных экспериментов ученые тестировали добавки на рыбках данио-рерио. Например, антиоксидантный эффект препаратов проверялся на животных, у которых был смоделирован процесс повышенного окисления клеток. Эксперименты с данио-рерио увенчались успехом, а в дальнейшем антиоксидантное действие синбиотиков подтвердилось и в испытаниях на форели и стерляди.

«Данио-рерио — широко применяемая во всем мире модель для исследований. Ее использование позволяет быстро и с меньшими затратами оценить общую безопасность и эффективность наших добавок на живом организме, — объясняет Д.В. Рудой. — С помощью данио-рерио мы можем смоделировать различные проблемные состояния — например, оксидативный стресс (вызванный перекисью водорода) или генотоксический стресс (вызванный химическим мутагеном). На этой модели мы тестируем, как наши пробиотики защищают организм, снижая уровень повреждений ДНК и клеточного стресса».

Прибор для массового параллельного секвенирования «Нанофор СПС», применяемый при разработке синбиотических кормовых добавок.Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

Прибор для массового параллельного секвенирования «Нанофор СПС», применяемый при разработке синбиотических кормовых добавок.

Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

 

Ученые также провели метагеномный анализ кишечного микробиома мальков и молоди стерляди, получавших инновационные добавки. Это исследование показало, что новые препараты способствуют формированию собственной микробиоты рыб. Кстати, анализ микробиома можно использовать и непосредственно для того, чтобы подобрать наиболее эффективные кормовые добавки для конкретного хозяйства.

«Для изучения микробиома в динамике используются современные методы секвенирования. Один из ключевых подходов — анализ вариабельных участков гена 16S рибосомной РНК. Этот ген есть у всех бактерий, и по его вариациям мы можем определить, какие именно бактерии присутствуют в образце, — поясняет Д.В. Рудой. — Для этого мы применяем высокопроизводительное секвенирование на платформах типа Illumina, что позволяет получать данные о составе микробиома буквально за несколько часов прямо в лаборатории. Важно отметить, что в России также разработан и уже применяется отечественный прибор для массового параллельного секвенирования — “Нанофор СПС”. Наличие такого прибора в научно-исследовательской лаборатории «Центр агробиотехнологии» ДГТУ открывает широкие перспективы для изучения генетических особенностей пробиотических штаммов и оценки их влияния на организм животных».

Представители семейства Осетровых (Acipenseridae).Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

Представители семейства Осетровых (Acipenseridae).

Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

 

Как подчеркивает ученый, новая разработка играет важную роль в контексте текущего перехода к персонализированному рыбоводству. Вероятно, в будущем препараты-синбиотики будут разрабатываться не просто для конкретных видов рыб, а целенаправленно для отдельных хозяйств. Д.В. Рудой объясняет, как может выглядеть этот процесс: «Сначала мы проводим анализ текущих проблем и особенностей хозяйства: вида и возраста рыбы, условий ее содержания, определяем, какие патогены циркулируют на предприятии. Далее производится подбор штаммов с необходимыми свойствами. Используя разработанную нами методику, мы проверяем эти штаммы на совместимость, формируем мультиштаммовый препарат и предлагаем технологию его внесения в комбикорм».

Кстати, в рамках проекта ученые разработали собственные рецептуры стартовых комбикормов (для животных на ранних этапах жизни. — Примеч. авт.) для разных видов рыб с использованием новых синбиотиков и белков растительного происхождения. «Рецепты стартовых комбикормов с частичной заменой рыбной муки на растительный белок разработаны для личинок и молоди стерляди, форели, сома и тилапии, — делится исследователь. — Главное отличие этих кормов — включение в их состав синбиотических добавок, помогающих рыбам эффективно переваривать и усваивать компоненты растительного происхождения».

Важным достижением проекта стала уникальная коллекция из более 100 бактериальных штаммов, которые можно использовать в качестве пробиотиков для рыб. «Банк штаммов — это ресурс, который позволяет нам не только разрабатывать новые препараты, но и проводить глубокие фундаментальные исследования. Наша коллекция постоянно пополняется и актуализируется в соответствии с новыми потребностями и вызовами отрасли», — подчеркивает Д.В. Рудой.

Внешний вид комбикорма.Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

Внешний вид комбикорма.

Фото из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ

 

Стоит отметить, что более половины команды — молодые ученые. Высокие показатели достигаются за счет синергии проектных групп с различными специализациями: по биотехнологии, микробиологии, генетике, молекулярной биологии, кормопроизводству и аквакультуре. «Наши добавки и комбикорма прошли широкий цикл лабораторных и производственных испытаний на базе ДГТУ и его партнеров, а также на рыбоводных предприятиях, — подытоживает Д.В. Рудой. — Мы получили положительные результаты, подтверждающие их высокую эффективность, и сейчас идет активная работа по регистрации технологий для масштабирования в промышленное производство».

Разработки ведутся в рамках гранта Российского научного фонда № 23-76-30006 «Стратегия молекулярной аквакультуры в разработке новых синбиотических препаратов для улучшения здоровья и качества рыбы». Завершение проекта запланировано в 2026 г., но на этом научные исследования коллектива не заканчиваются. Ученые занимаются другими острыми проблемами рыбных хозяйств: поиском средств против грибкового заболевания рыб сапролегниоза, а также минимизацией потерь на этапах инкубации икры и раннего подращивания мальков. Кроме того, в 2025 г. исследователи выиграли еще один грант РНФ на создание пробиотиков и кормов для промышленного разведения раков — весьма непростых в содержании животных.

Статья подготовлена при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ

 

Источники

Комментарии Д.В. Рудого

Российский научный фонд. Дмитрий Рудой и Лариса Карпенко о развитии аквакультуры и птицеводства

Медиапортал Донского государственного технического университета. Аркадий Кузнецов. Грант РНФ по молекулярной аквакультуре: выживаемость рыбы выросла на 25%

Фото на превью и на главной странице: из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ. 

Фото на странице: из архива информационной службы факультета «Агропромышленный» ДГТУ, Дарьяна Буряк / архив отдела медиасопровождения управления информационной политики ДГТУ.