Газовый гидрат. Фото из личного архива Р.Б. Шакирова
Ученые лаборатории комплексных исследований окружающей среды и минеральных ресурсов Тихоокеанского океанологического института им. В.И. Ильичева ДВО РАН г. Владивосток совместно с коллегами лаборатории анаэробных микроорганизмов Института биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г. К. Скрябина РАН г. Пущино – обособленного подразделения ФГБУН «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований РАН» выделили и описали новый вид анаэробной сульфатвосстанавливающей бактерии (СВБ) из газогидратоносных донных отложений северной части Японского моря, обладающей уникальными свойствами – высокой способностью к деструкции алканов.
В морской среде алканы встречаются в районах выхода природного газа и просачивания сырой нефти, в газовых гидратах или антропогенно-загрязненных районах и являются важными источниками углерода и энергии для микроорганизмов. В донных отложениях кислород, как правило, детектируется только в пределах верхних слоев осадка, поэтому деградация органических соединений в основном происходит в анаэробных условиях. Анаэробное окисление алканов осуществляется в присутствии сульфата, нитрата, марганца или Fe (III) как конечных акцепторов электронов либо сульфатвосстанавливающими бактериями (СВБ), либо археями в тесной ассоциации с СВБ.
Штамм SRJS8Т был способен использовать для роста сырую нефть, преимущественно окисляя короткоцепочечные С9–С12 н-алканы: нонан (100%), декан (62.6%), ундекан (57.3%) и додекан (45.6%). Меньшей степени деградации (11.5–31.3%) подвергались С13–С20 и С28–С31 н-алканы, и лишь в незначительной степени (1.02–6.72%) длинноцепочечные С21–С27 н-алканы.
Данное свойство среди сульфатвосстанавливающих бактерий встречается крайне редко. До настоящего времени выделено и описано всего лишь 5 чистых культур СВБ, обладающих данной способностью, но имеющих гораздо меньшую эффективность нефтедеструкции по сравнению с новым видом, и ни одна из них не относится к роду Desulfosporosinus.
Штамм SRJS8Т отнесен к новому виду рода Desulfosporosinus, для которого предложено название Desulfosporosinus shakirovi sp. nov.
Новая бактерия Desulfosporosinus shakirovi названа в честь ученого-геолога, внесшего большой вклад в организацию и развитие геомикробиологических исследований в Дальневосточном регионе России, д.г.-м.н., доцента Шакирова Рената Белаловича – заведующего лабораторией газогеохимии ТОИ ДВО РАН. Образцы осадка, в которых была обнаружена новая бактерия, были им отобраны в ходе экспедиции ТОИ ДВО РАН, в 54 рейсе НИС «Академик Опарин», 2017 г. Новый штамм депонирован во всероссийскую и международные коллекции и базы данных в установленном порядке.
Результаты исследования опубликованы в журнале «Микробиология».
Информация и фото предоставлены Тихоокеанским океанологическим институтом им. В.И. Ильичева ДВО РАН
