Павел Мальков

Павел Мальков

 

Сотрудники лаборатории математических методов обработки изображений факультета ВМК МГУ совместно с сотрудниками факультета фундаментальной медицины МГУ имени М.В. Ломоносова создали приложение, позволяющее студентам медицинских специальностей рассматривать полнослайдовые гистологические изображения так, как если бы они использовали для этого реальный микроскоп. Приложение уже используется в качестве инструмента самостоятельной подготовки к практическим занятиям по курсу патологической анатомии.

Универсальное кроссплатформенное программное средство PathScribe значительно упрощает работу с гистологическими изображениями, имеющими разные форматы, без потери качества конвертируя их в свой формат, позволяя быстро открывать и просматривать коллекции изображений, занимающие сотни гигабайт, даже при плохом качестве интернет-соединения. 

В отличие от других медицинских изображений, с гистологическими довольно сложно работать: в силу большого разрешения и размера изображений (типичное разрешение одного изображения 100 000 на 100 000 пикселей, размер 3 гигабайта) их трудно и долго передавать и просматривать. Более того, гистологические изображения, снятые при помощи сканеров, произведенных разными компаниями, имеют разные форматы, из-за чего одновременно открывать изображения с разных сканеров крайне неудобно.

Новая программа PathScribe учитывает все эти особенности и способна работать с разными форматами, предварительно переводя их в свой собственный. Преподаватели курса патологической анатомии факультета фундаментальной медицины создали структурированное описание для каждого изображения в PathScribe.

«Под программу разработан специальный формат, который конвертирует исходные файлы без потери качества, что очень важно, и значительно уменьшает их “вес”. Благодаря этому изображения быстро загружаются даже с плохо работающим Wi-Fi. Это безусловное преимущество», – пояснил доктор медицинских наук, заведующий отделом клинической патологии Медицинского научно-образовательного центра МГУ, профессор факультета фундаментальной медицины Павел Мальков.

Программное средство PathScribe разработал кандидат физико-математических наук, научный сотрудник лаборатории математических методов обработки изображений кафедры математической физики факультета ВМК МГУ, победитель конкурса грантовой поддержки Некоммерческого фонда развития науки и образования «Интеллект» Александр Хвостиков под руководством своего научного руководителя, доктора физико-математических наук, профессора, заведующего лабораторией математических методов обработки изображений факультета ВМК МГУ Андрея Крылова.

«Новую программу мы апробировали в учебном процессе осеннего семестра этого года. И она показала свою эффективность – увеличилось количество препаратов, которые могут изучить студенты за одну лекцию. К тому же им больше не нужно для дополнительного изучения посещать аудиторию с микроскопами. Программой можно пользоваться, находясь где угодно, нужен лишь смартфон, планшет или компьютер для входа. PathScribe позволяет рассмотреть изображение на разных увеличениях и с разных полей зрения. Планируется масштабирование программы благодаря новому серверу, приобретенному фондом «Интеллект» для факультета ВМК», – рассказал доктор физико-математических наук, профессор, заведующий лабораторией математических методов обработки изображений факультета ВМК Андрей Крылов

В ближайшее время приложение будет использоваться в учебных программах других российских и зарубежных вузов: программой заинтересовался Индийский институт технологий в Бомбее, с которым сотрудничает лаборатория математических методов обработки изображений факультета ВМК. Сейчас в меню программного обеспечения можно по выбору работать на русском или английском языке. 

 

Информация предоставлена пресс-службой МГУ 

Источник фото: fbm.msu.ru