Материалы портала «Научная Россия»

0 комментариев 689

Учёные разработали новый метод изучения структуры внутриклеточных взаимодействий

Ученые разработали новый оригинальный метод построения схемы (графа) взаимодействий основных транскриптомных «игроков» клетки – мРНК, микроРНК и транскрипционных факторов

Ученые механико-математического факультета МГУ совместно с коллегами с факультета биологии и биотехнологии Высшей школы экономики и из Московского научно-исследовательского онкологического института имени П.А. Герцена разработали новый оригинальный метод построения схемы (графа) взаимодействий основных транскриптомных «игроков» клетки – мРНК, микроРНК и транскрипционных факторов. Метод позволяет объединить и использовать совместно два пласта данных – общий и специфичный для конкретного типа ткани, патологии или эксперимента. Открытие учёных позволит в том числе добиться новых результатов, связанных с созданием экспрессионных тест-систем для прогнозирования рака. Статья опубликована в журнале PLOS ONE.

© РИА Новости / Евгений Одиноков

© РИА Новости / Евгений Одиноков

 

Происходящие на молекулярном уровне внутриклеточные взаимодействия можно сравнить с оркестром, исполняющим симфонию, или со спортивной командой, выполняющей сложную тренерскую установку. Анализ этих взаимодействий позволяет не только лучше понять механизмы работы клеточной машинерии, но и идентифицировать ее центральные элементы, наблюдение за которыми позволяет наиболее полно делать выводы и прогнозы, связанные с состоянием клеток и организма в целом. Предложенный метод может оказаться полезным молекулярным биологам и биоинформатикам для  уточнения понимания структуры молекулярных взаимодействий внутри клетки, а также для выявления ключевых элементов в этой системе взаимодействий.

«Дополнительный интерес, в  том числе прикладной, связан с комбинированным использованием предложенного метода с методом in silico построения транскриптомных тест-систем, разработанным и реализованным учеными механико-математического факультета МГУ в сотрудничестве со специалистами других научных центров с активным использованием ресурсов Суперкомпьютерного центра МГУ. Такая комбинация позволит добиться новых результатов, связанных с созданием экспрессионных тест-систем, которые можно будет использовать в клинической практике. В частности, в статье показана эффективность этого сочетания методов применительно к прогнозированию риска рецидива рака молочной железы», — отметил один из авторов работы, старший научный сотрудник кафедры математической теории интеллектуальных систем механико-математического факультета МГУ Алексей Галатенко.

 

Информация предоставлена пресс-службой МГУ

Источник фото: https://ria.ru/

МГУ внутриклеточные взаимодействия микроРНК тест-системы

Назад

Социальные сети

Комментарии

Авторизуйтесь, чтобы оставить комментарий

Информация предоставлена Информационным агентством "Научная Россия". Свидетельство о регистрации СМИ: ИА № ФС77-62580, выдано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций 31 июля 2015 года.