Слово «докинг» в английском языке означает стыковку космического корабля с Международной космической станцией, а также швартовку корабля в гавани, его постановку в сухой док для ремонта. Но сегодня докинг стал значимым термином для фармацевтических производств и разработчиков лекарств. С помощью докинга специалисты перебирают молекулы многих тысяч имеющихся в наличии органических соединений, которые можно заказать и отдать на эксперимент, и выбирают из них наиболее перспективные — кандидаты в ингибиторы для последующей экспериментальной проверки. О поиске новых ингибиторов — лекция Владимира Борисовича Сулимова, доктора физико-математических наук, заведующего лабораторией вычислительных систем и прикладных технологий программирования НИВЦ МГУ им. М.В. Ломоносова, лауреата премии имени М.В. Ломоносова за научные работы I степени 2019 г. за цикл работ «Разработка и применение методов молекулярного моделирования для создания лекарств».

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ:

  • Сулимов В.Б., Сулимов А.В. Докинг: молекулярное моделирование для разработки лекарств. М.: ИИнтеЛЛ, 2017.
  • Sulimov V.B., Ilin I.S., Kutov D.C., Sulimov A.V. Development of docking programs for Lomonosov supercomputer // Journal of the Turkish Chemical Society Section A: Chemistry. 2020. Vol. 7. № 1. P. 259–276.
  • Sulimov V.B., Kutov D.C., Taschilova A.S., Ilin I.S., Tyrtyshnikov E.E., Sulimov A.V. Docking paradigm in Drug Design // Current Topics in Medicinal Chemistry. 2021. Vol. 21. № 6. P. 507–546.
  • Хельтье Х.-Д., Зиппль В., Роньян Д., Фолькерс Г. Молекулярное моделирование. Теория и практика / пер. с англ. М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2009.
  • Alvarez E.J., Shoichet B. Virtual screening in drug discovery. Taylor & Francis, 2005.

Информационные слайды предоставлены В.Б. Сулимовым.

Лекция подготовлена при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ и Российской академии наук.