Ему предписали «заняться…  исправлением таблиц движений на небесах и положений неподвижных звезд для усовершенствования искусства кораблевождения». Но средств для покупки нужных инструментов не дали, и Флемстид потратил на оснащение обсерватории отцовское наследство и деньги богатого друга. 15 лет Флемстид усидчиво производил наблюдения. Результаты двадцати тысяч наблюдений он  изложил в труде «Британская история неба». В третьей его части, знаменитом «Британском каталоге» содержатся данные о положении трех тысяч звезд. Звезды в каталоге специфически пронумерованы,  эту нумерацию Флемстида применяют и сегодня.