Материалы портала «Научная Россия»

Ученые нашли способ быстро предсказывать структуру белковых комплексов

Ученые нашли способ быстро предсказывать структуру белковых комплексов
Исследование ученых из МФТИ поможет ускорить разработку новых лекарств от болезней, вызванных ошибочными белковыми взаимодействиями.

Математики и биологи, представляющие МФТИ и университет Стони Брук, разработали метод быстрого и точного предсказания строения «сцеплений» белков в клетках. Новый подход позволяет моделировать взаимодействия белков на уровне генома и приведет к разработке новых лекарств от болезней, вызванных ошибочными белковыми взаимодействиями. Статья ученых опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA.

Задача ученых — из всех возможных вариантов расположения двух больших молекул относительно друг друга получить такую, которая существует в реальном мире, показать, как будет выглядеть «стыковка» двух белков с известной структурой. Если провести аналогию с конструктором типа «Лего», вычислительную сложность такой операции можно сравнить с составлением всех возможных пар из 10 тысяч начальных блоков конструктора.

Идея исследователей состояла в том, чтобы представить белки как сочетание «квантовых поверхностей» — некоторых блоков, описываемых математическим аппаратом квантовой механики. Такой подход позволяет одновременно рассчитывать взаимодействие многих пар белковых участков между собой, а не оценивать каждую пару независимо. Метод может работать до 100 раз быстрее существующих ранее, при этом оставаясь точным. Новый алгоритм скоро станет частью популярной автоматической системы расчета белок-белкового взаимодействия ClusPro.

cluspro взаимодействие белков структура белковых комплексов

Назад

Социальные сети

Комментарии

Авторизуйтесь, чтобы оставить комментарий