Ученые из Института биоорганической химии РАН создали базу данных пептидных токсинов из яда скорпионов. База, получившая название Kalium, поможет систематизировать информацию о молекулах, блокирующих калиевые каналы, и станет полезным инструментом для дальнейшего изучения самих каналов, которые считаются фармакологической мишенью при некоторых аутоиммунных, онкологических и нейродегенеративных заболеваниях. Результаты работы опубликованы в журнале Database: The Journal of Biological Databases and Curation.
Поскольку калиевые каналы являются самым представленным суперсемейством ионных каналов, систематизация актуальной информации о молекулах, действующих на них, особенно актуальна для современной биоорганической химии и фармакологии. С 80-х годов прошлого века, когда ученые знали всего 5-10 пептидных молекул, количество подобной информации резко возросло, и возник определенный хаос в классификации этих молекул.
В настоящее время база данных Kalium содержит 174 токсина, существование которых подтверждено на уровне белка, то есть они были выделены непосредственно из животных или получены генно-инженерным способом. Кроме того, в базе собраны сведения только о реально существующих молекулах, а также рассчитана молекулярная масса с учетом замыкания дисульфидных связей и приведен эффект на молекулярную мишень (конкретные изоформы калиевых каналов).
В ближайшее время исследователи планируют дополнить Kalium пептидами, выделенными из других животных: пауков, конусов (хищных моллюсков), анемон (коралловых полипов), пчел и змей.
